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Graph Generator Service
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This service generates all the charts and visualizations required for the medical report.
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Based on the analysis notebooks in services_dfdf/.
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é N)ÚPath)ÚFancyBboxPatchc óž — e Zd ZdZddefd„Zdedefd„Z ddej de
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d„Z ddej de
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defd„Zy)ÚGraphGeneratorz'Generate all charts for medical reportsÚ
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charts_dirc ó\ — t |« | _ | j j d¬« y)z{
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Initialize the graph generator.
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Args:
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charts_dir: Directory to save generated charts
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T)Úexist_okN)r r Úmkdir)Úselfr s úU/home/oluwasanmi/Documents/Work/MKD/report_generation/app/services/graph_generator.pyÚ__init__zGraphGenerator.__init__ s% € ô ˜zÓ*ˆŒØ �‰× Ñ tÐ Õ,ó Ú
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Convert image file to base64 string.
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Args:
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image_path: Path to image file
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Returns:
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Base64 encoded string
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Úrbzutf-8NÚ )ÚopenÚbase64Ú b64encodeÚreadÚdecodeÚFileNotFoundError)r r Ú
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image_files r Ú_image_to_base64z GraphGenerator._image_to_base64 s] € ð Ü�j $Ó'ð
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Generate respiratory chart (VT and Speed over time).
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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ÚPHASE©ÚsubsetúT(sec)©é é ©ÚfigsizezVT(l)_smoothedzVT (L)©ÚdataÚxÚyÚlabelú
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Time (sec)Tçš™™™™™¹?©Úalphar é éÈ ÚSpeedÚgreenú
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steps-posté ©r) r* r+ ÚcolorÚaxÚ drawstyleÚ linewidthr, é é ú
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upper left©Úlocé çš™™™™™É?Ú lightblue©r0 r8 Úpurpleé Ú
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lightgreenÚbluezrespiratory.pngé, Útight©ÚdpiÚ bbox_inches) Údrop_duplicatesÚtolistÚpltÚfigureÚsubplotÚsnsÚlineplotÚ
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set_xlabelÚ
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set_ylabelÚgridÚset_ylimÚminÚmaxÚtwinxÚ
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set_xticksÚnpÚarangeÚ
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get_legendÚremoveÚget_legend_handles_labelsÚlegendÚlenÚaxvspanr ÚsavefigÚcloser Ústr© r r r Úfirst_unique_phaseÚ phase_timesÚax1Úax2Úlines1Úlabels1Úlines2Úlabels2Ú
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chart_paths r Úgenerate_respiratory_chartz)GraphGenerator.generate_respiratory_chart0 sa € ð × /Ñ /°wÐ /Ó ?ÐØ(¨Ñ2×9Ñ9Ó;ˆ ä �
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Generate fuel utilization chart (CHO vs FAT by stage).
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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Generate VO2 Pulse chart with HR and Speed.
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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Generate VO2 per Breath chart.
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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Generate fat metabolism chart (CHO vs FAT over time).
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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Generate recovery chart (VCO2, HR, and BF).
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Args:
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df: Processed DataFrame with smoothed columns
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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r r r" r# r& zVCO2(ml/min)_smoothedz
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VCO2 (ml/min)rH rÆ r- rÅ r z VCO2(ml/min)Tr. r/ rÇ r“ r6 r– rÈ rÉ r= r+ r— rÊ rË zBF(bpm)_smoothedr4 zBF (bpm)r2 r> r? rA rB rC rD rE rF rG zrecovery_chart.pngrJ rI rÎ ) rN rO rP rQ rR rS rT rU rV rX rZ rW r[ rY r± rÏ rÐ r\ r] r^ r_ r` ra rb rc rd r re rf r rg rÑ s r Úgenerate_recovery_chartz&GraphGenerator.generate_recovery_chartî s_ € ð × /Ñ /°wÐ /Ó ?ÐØ(¨Ñ2×9Ñ9Ó;ˆ ä �
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Generate body composition donut chart.
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Args:
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fat_mass_lbs: Fat mass in pounds
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lean_mass_lbs: Lean mass in pounds
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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Returns:
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Base64 string or file path
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rx z#fde3acz#ff9966)r1 r1 r& r éZ r‹ Úw)r| Ú edgecolor)ÚautopctÚ
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startangleÚ
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wedgepropsÚcolorsÚlabelsru r= z
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Fat Mass (rƒ zlbs)
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round,pad=0.3r‡ ry )ÚboxstyleÚ facecolorr0 )r� rŠ rˆ r‰ Úbboxz Lean Mass (Úequalzbody_composition_chart.pngrJ iX rÎ ) rP rQ ÚpieÚdictr¯ r˜ r re rf r rg )
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r rÞ rß r Ú total_weightÚfat_percentageÚlean_percentageÚsizesrç rq s
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r Ú generate_body_composition_chartz.GraphGenerator.generate_body_composition_chartJ sQ € ð $ mÑ3ˆ Ø&¨ Ñ5¸Ñ<ˆØ(¨<Ñ7¸3Ñ>ˆà Ð1ˆØ˜YÐ'ˆä �
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Generate body fat percentage chart.
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Args:
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fat_percentage: Body fat percentage
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age: Patient age
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gender: Patient gender ('male' or 'female')
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save_as_base64: If True, return base64 string, else return file path
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